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海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析

作者: 王元 [1] 周俊芳 [1] 韦信贤 [2] 马荣荣 [3] 赵姝 [1] 李新苍 [1] 房文红 [1]

关键词: 凡纳滨对虾 肠道 鳃 海水养殖 淡水养殖 菌群结构 高通量测序

摘要:运用Miseq高通量测序技术,分析凡纳滨对虾虾苗及其在海水和淡水2种养殖条件下生长到体长9~10 cm时的肠道和鳃的菌群结构.结果显示:虾苗、肠道和鳃样品在门水平上菌群均以厚壁菌门和变形菌门为主,但丰度差异较大;在属水平上,虾苗菌群以乳球菌属(36.1%)、未成功分属的γ–变形菌纲的菌株(25.5%)、芽孢杆菌属(13.5%)、Solibacillus(7.9%)、假单胞菌属(5.0%)和节杆菌属(2.5%)为主,鳃的菌群以乳球菌属、芽孢杆菌属、Solibacillus、假单胞菌属和节杆菌属为主,肠道菌群在海水养殖中的以发光杆菌属(22.9%)、弧菌属(18.2%)、乳球菌属(13.3%)、纤维弧菌属(8.0%)、希瓦氏菌属(5.5%)和芽孢杆菌属(5.4%)为主,而在淡水养殖中的以希瓦氏菌属(57.4%)、乳球菌属(18.8%)和芽孢杆菌属(6.3%)为主,弧菌丰度小于0.1%.养殖条件对凡纳滨对虾鳃中菌群结构影响较小,但对肠道菌群结构影响较大.


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