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松材线虫磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1基因的克隆及表达

作者: 王步勇 [1] 问荣荣 [1] 马玲 [2] 周天华 [1] 张萌 [1]

关键词: 松材线虫 磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1基因 基因克隆 原位杂交 表达分析 RNA干扰

摘要:应用BLAST比对技术,在松材线虫基因组数据中鉴定得到模式线虫pdk-1的同源基因Bxpdk-1.结合RT-PCR技术进行Bxpdk-1基因完整蛋白编码区(CDS)扩增,得到CDS区全长2298 bp.BxPDK-1蛋白含有"STKc_PDK1""PH_PDK1"2个保守结构域,属于磷酸肌醇激酶超家族.序列比对及进化树分析显示,松材线虫BxPDK-1蛋白与捻转血矛线虫PDK-1蛋白(CDJ88126.1)同源性为50%,进化树聚在同一小分支上,亲缘关系较近.原位杂交试验表明,Bxpdk-1基因主要在线虫的头部神经元及咽部神经处表达.qPCR结果分析显示,Bxpdk-1基因表达响应鱼藤酮药剂胁迫处理.RNAi试验显示,Bxpdk-1在dsRNA处理12 h时,基因表达量显著下降,基因被沉默.


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